平成22年度の税制改正において、所得税の寄付金控除の適用下限額は、改正前の5千円から2千円に引き下げられました。
一方、住民税（道府県民税＋市町村民税）においては、改正はありませんでした。
寄付金の取扱に関しては、所得税では所得控除（政党等寄付金は除く）ですが、住民税は税額控除です（政党等寄付金の税額控除はありません）。
住民税の寄付金税額控除の方法
税額控除額は、通常、｛寄付金額の合計（総所得金額等の30％が限度）－5千円｝×10％です（基本控除額）。
寄付金額4万円であれば、住民税の税額控除額は、3,500円「（４万円－5千円）×10％」です。
ところが、寄付金がふるさと納税といった地方公共団体の場合には、上記控除額（基本控除額）に「特例控除額」が加算されます。この「特例控除額」とは、次の算式で求められます。
（寄付金額－5千円）×（90％－所得税の限界税率）所得税の限界税率とは、所得税の税率です。
なお、特例控除額は、住民税所得割額の10％が上限です。
具体的な税額控除額の計算
例えば、給与収入700万円で夫婦子２人、ふるさと納税（寄付金）４万円のケース（住民税所得割296,000円、所得税の限界税率10％）で試算してみましょう。
①住民税の基本控除額
（4万円－5千円）×10％＝3,500円
②住民税の特例控除額
（4万円－５千円）×（90％－10％）
35,000円×80％＝28,000円
住民税所得割の10％は29,600円なので28,000円は限度額の範囲内です。
計算の結果、税額控除額は31,500円（①＋②）となります。
全く同じ条件で同額の寄付金でも、ふるさと納税など地方公共団体以外の寄付金であれば、負担率91.25％（40,000円－3,500円／40,000円）、一方、寄付金がふるさと納税であれば負担率21.25％（40,000円－31,500／40,000円）です。さらに、所得税（実効税率10％）を考慮すると負担率11.75％と軽減されます。ふるさと納税の寄付金の有利性が際立っています。上限はありますが、この負担率は、所得とふるさと納税の寄付が増えるにつれて軽減します。
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